De Josephine Nefkens Stichting zet zich in voor de ontwikkeling van betere therapieën voor de behandeling van kanker en selecteert kwalitatief sterke research projecten van internationaal niveau voor financiering. Researchprojecten die voor ondersteuning door de Stichting in aanmerking komen, kunnen gericht zijn op het verbeteren van ons inzicht in achterliggende biologie van het ontstaan en de progressie van kanker, op de ontwikkeling van nieuwe behandelmethoden, of op de verbetering van de preventie en (vroeg)diagnostiek van kanker (herkenning en onderscheiden van verschillen tussen patiënten en binnen tumoren). Aanvragen kunnen behalve programmatische research ook infrastructurele investeringen (bijv apparatuur) behelzen. De inhoudelijke kaders van onderzoek waar de Stichting steun aan verleent zijn ruim; de kwaliteitscriteria, de originaliteit en mogelijkheid dat dit leidt tot echte doorbraken zijn bepalend. Aanvragende onderzoekers en de instellingen waar zij werkzaam zijn dienen een bewezen reputatie en kritische massa te bezitten in het betreffende veld van kankeronderzoek.
Ter vermijding van overbodig werk en ter bevordering van de effectiviteit van aanvraag-beoordelingen wordt gewerkt met een vooraanmelding. Het bestuur zal beoordelen of de vooraanmelding leidt tot een uitnodiging voor het indienen van een volledig voorstel. Het format voor de vooraanmelding is beschikbaar op deze site, zie bovenaan de website. In de tweejaarlijkse bestuursvergaderingen (april en oktober) zal een besluit worden genomen over de volledige voorstellen. Indien een volledig voorstel minstens 4 weken voor de komende bestuursvergadering is ingediend zal deze meegenomen worden in de komende bestuursvergadering. Indien de aanvraag minder dan 4 weken voor de komende bestuursvergadering wordt ingediend, zal het besluit doorgeschoven worden naar de volgende bestuursvergadering.